Основные характеристики:
- Четыре капилляра;
- Возможность комплектации до 16-капилляров;
- Возможность работы 24 часа без оператора;
- Простой ввод прибора в работу;
- Автоматическое заполнение полимером и образцом из 96 пробирок и 384-луночных плашек;
- Множество применений;
- Многоцветное детектирование.
В комплект системы Applied Biosystems 3130 входит:
- Прибор для проведения капиллярного электрофореза
- Компьютер для обработки данных и управления прибором
- Программное обеспечение для определения нуклеотидных последовательностей и анализа фрагментов и др.
Наборы для прикладных исследований:
- Диагностика заболеваний;
- Идентификация личности;
- Идентификация микроорганизмов;
- Подтверждение родословных у животных.
Выявление "больничных инфекций": полное или частичное секвенирование генома микроорганизмов с помощью Applied Biosystems MicroSeq Microbial Identification System (бактерии и грибки).
Пересадка органов и тканей: мутации в генах HLA (комплекса гистосовместимости).
Мутации в генах системы иммунного ответа (интерлейкины, т.п.). С помощью системы ресеквенирования VariantSEQr™ Resequencing System проводится полное секвенирование гена с целью сравнения последовательностей с референсной последовательностью для выявления любых встречающихся вариаций и идентификации мутаций, которые могут коррелировать с развитием заболевания.
Воспроизводимость и производительность:Быстрый сиквенс:
| Пример применения | Сравнительное секвенирование и SNP |
| Воспроизводимость | 98% точность в определении основания |
| Полимер | РОР 6 |
| Длина капилляра* | 36 см |
| Время и температура** | 60 минут при 500С |
| Размер | 500 н |
| Производительность за 24 часа *** | 48000 оснований |
Стандартный сиквенс: |
|
| Пример применения | ДНК секвенирование |
| Воспроизводимость | 98% точность в определении основания |
| Полимер | РОР 6 |
| Длина капилляра* | 50 см |
| Время и температура** | 2,5 часа при 500С |
| Размер | 650 н |
| Производительность за 24 часа *** | 23400 оснований |
Длинный сиквенс: |
|
| Пример применения | ДНК секвенирование |
| Воспроизводимость | 98% точность в определении основания |
| Полимер | РОР 4 |
| Длина капилляра* | 80 см |
| Время и температура** | 3,5 часа при 500С |
| Размер | 950 н |
| Производительность за 24 часа *** | 22800 оснований |
Фрагментный анализ ДНК: |
|
| Пример применения | Микросателлитный анализ и сравнит. генотипирование |
| Воспроизводимость | - |
| Полимер | РОР 4 |
| Длина капилляра* | 22 и 36 см |
| Время и температура** | 20 мин (22см) (36см) при 600С |
| Размер | 400 н |
| Производительность за 24 часа *** | 5760 генотипов (22 cм) 2560 генотипов (36 cм) |
Скрининг мутаций: |
|
| Пример применения | SNP скрининг |
| Воспроизводимость | SNP идентификация с пятицветной флуоресценцией |
| Полимер | РОР 4 |
| Длина капилляра* | 22 см |
| Время и температура** | 15 минут при 600С |
| Размер | 100 н |
| Производительность за 24 часа *** | 3840 генотипов |
* внутренний диаметр капилляра 50 микрон для всех четырех капилляров;
** время затрачиваемое на определение размера фрагмента, включая заполнение капилляра и электрофорез;
*** определение основания начинается с 21 основания.
Для оптимизации разрешения, как и в случае картирования, Applied Biosystems рекомендует использовать капилляр длиной 36см. Однако капилляр 22 см может быть использован для быстрого сканирования генома при использовании маркеров менее 360 пар оснований.
Applied Biosystems 3130 Genetic Analyzer включает:- Applied Biosystems 3130 Genetic analyzer: краткое руководство;
- Одно из программных обеспечений: Sequencing или GeneMapper;
- Капиллярный картридж;
- Установка прибора у заказчика, один год гарантийного обслуживания.